ICT·바이오 초기 발굴사 매각 저울질, 임상 자산은 본사 편입···일동제약 R&D '재편'

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초기 발굴사 매각 저울질, 임상 자산은 본사 편입···일동제약 R&D '재편'

등록 2026.11.13 16:47

이병현

  기자

유노비아 분사 2년 7개월 만 흡수합병···아이디언스 FI 구주·풋옵션 368억원에 승계아이리드비엠에스, 주력 파이프라인 임상 진입 목전서 다각도 검토외부 지분·중복상장 규제에 난항···현금 압박 속 후기 과제 중심 압축

그래픽=홍연택 기자그래픽=홍연택 기자

일동제약이 연구개발(R&D) 자회사 지배구조와 파이프라인 포트폴리오를 전면 재조정하고 있다. 저분자 신약 후보물질 발굴을 전담한 아이리드비엠에스는 경영권 매각을 포함한 지분 정리 가능성을 열어둔 반면, 임상 단계에 진입한 신약 자산은 본사로 합치거나 외부 투자자 지분을 직접 사들이는 행보를 보이고 있다.

아이리드비엠에스, 경영권 매각 추진설


13일 금융감독원 전자공시시스템과 제약·바이오업계에 따르면 일동제약은 전날 아이리드비엠에스 경영권 매각 추진 보도에 대한 해명 공시를 내고 "계열사와 관련해 여러 가지 가능성을 열어두고 다각도로 검토 중인 단계이나 현재까지 구체적으로 결정된 사항은 없다"고 밝혔다. 매각 추진 가능성 자체를 부인하지 않은 채 원론적인 입장을 내놓은 것으로, 회사는 확정 시점 또는 다음 달 11일까지 후속 진행 상황을 재공시할 예정이다.

아이리드비엠에스는 일동제약 중앙연구소 사내 벤처로 출발해 2020년 12월 스핀오프한 저분자 합성신약 연구 기업이다. 일동제약은 2021년 7월 130억원을 출자해 지분 40%를 확보한 데 이어 올해도 전환우선주(5차) 100만주를 50억원에 추가 인수하며 누적 출자액을 약 149억원(상반기 말 지분율 48.9%)까지 늘렸다. 출범 당시만 해도 항암 신약 개발사 아이디언스 등과 유기적으로 결합해 후보물질 도출 속도를 끌어올리는 그룹 R&D 전초기지 역할을 맡았다.

문제는 자체 매출 기반이 없는 상태에서 연구 기간이 길어지며 불어난 재무적 결손이다. 아이리드비엠에스는 지난해 말 자산 8억원, 부채 61억원으로 약 53억원 규모의 자본잠식에 빠졌고, 올해 상반기 말에는 자산 37억원, 부채 112억원, 자본총계 마이너스(-) 75억원으로 완전자본잠식 폭이 한층 깊어졌다. 상반기에만 22억원의 당기순손실을 내는 등 기술수출 성과가 가시화되기 전까지 모회사의 추가 자금 수혈이 불가피한 상태다.

특히 시장이 주목하는 대목은 매각설이 불거진 시점이다. 아이리드비엠에스의 핵심 파이프라인은 본임상 진입 문턱에 와 있다. 미국 식품의약국(FDA)에서 각각 위암과 특발성 폐섬유증 희귀의약품 지정(ODD)을 받은 고형암 치료제(분자접착제) 'IL2106'은 올해 4분기, 자가면역·섬유화 질환 치료제 'IL21120033'은 일정 조정을 거쳐 내년 1분기 임상 1상 시험계획(IND) 제출을 목표로 잡고 있다. 통상 신약 개발에서 비임상을 마치고 인체 임상에 진입하는 시점부터 개발 비용이 급격히 불어난다.

아이리드비엠에스의 경우 지난 6월 흡수합병한 유노비아처럼 본사로 끌어안기도 어렵다. 일동제약이 지분 100%를 보유했던 물적분할 자회사 유노비아와 달리, 아이리드비엠에스는 외부 주주 지분이 51.1%에 달한다. 흡수합병을 추진할 경우 까다로운 합병비율 산정과 외부 주주에 대한 합병 대가 지급, 기존 주주 지분 희석 논란을 감수해야 한다. 자체 기업공개(IPO)를 통한 자금 조달을 꾀하기에도 강화된 중복상장 가이드라인이 걸림돌로 작용한다.

R&D 체계 개편 본격화


이번 일동제약의 R&D 체계 개편은 초기 탐색 연구부터 후기 임상까지 다양하던 자회사 모델을 접고, 본사 재무 여력이 감당할 수 있는 범위로 파이프라인을 압축하는 과정으로 요약된다. 과거 여러 R&D 자회사를 분사해 초기 발굴부터 임상까지 독자 생존시키겠다던 '신약 생태계' 구상에서 발을 빼고, 상업화 가시성이 높은 후기 자산 위주로 전선을 좁히는 모양새다.

일동제약의 R&D 외연 축소와 본체 중심 통합은 상반기부터 본격화됐다. 회사는 2023년 11월 R&D 부문을 물적분할해 설립했던 유노비아를 분사 2년 7개월 만인 지난 6월 다시 흡수합병했다. 분사 당시 외부 투자 유치로 독립적인 R&D 재원을 마련하겠다는 청사진을 제시했으나, 유노비아는 지난해 말 결산 기준 자산 66억원, 부채 213억원, 자본총계 마이너스 147억원의 완전자본잠식에 빠졌고 연간 77억원의 순손실을 냈다.

분사 기간 동안 일동제약의 손익계산서를 개선하는 효과는 거뒀다. 연결 기준 R&D 비용은 2023년 1112억원에서 2024년 463억원, 지난해 356억원으로 대폭 깎였고, 같은 기간 연결 영업손익은 539억원 적자에서 2024년 131억원, 지난해 195억원 흑자로 돌아섰다. 하지만 중복상장 규제 강화로 유노비아의 독자 상장 실익이 사라진 데다, 혁신형 제약기업 재인증(약가 우대)을 위해 본사 R&D 투자 비율을 높여야 하는 정책적 과제까지 겹치면서 결국 적자 자회사를 다시 합치는 쪽으로 결론을 냈다.

아이디언스 RCPS 인수


한편 임상 진척도가 앞선 항암제 계열사 아이디언스에 대해서는 현금을 투입해 직접 지분을 확보했다. 일동제약은 지난 9월 말 이사회 결의를 통해 아이디언스 상환전환우선주(RCPS) 709만7016주를 약 367억5500만원에 현금 취득하기로 하고 지난달 두 차례에 걸쳐 대금 납입을 진행했다. 종전 0%였던 일동제약의 아이디언스 직접 지분율은 13.95%로 올라섰다. 아이디언스의 주력 표적항암제 '베나다파립(IDX-1197)'은 올해 3월 미 FDA 패스트트랙 지정을 받았고, 한·미 위암 병용요법 임상 1b/2a상 마무리를 앞두고 다국가 허가임상(2b/3상)을 준비 중이다. 2대 주주인 동아에스티(2024년 250억원 투자)와 병용 개발 협업 및 유라시아·중동 권역 라이선스 계약 등 상업화 기반도 상대적으로 탄탄하다.

이번 368억원 투자는 외부 재무적투자자(FI)가 보유하던 시리즈A·B RCPS 구주를 발행 당시 가격 그대로 사들이는 거래여서 대금은 기존 투자자에게 흘러갔다. 특히 해당 RCPS에는 발행 3년 경과 후 아이디언스에 연복리 7% 조건 등으로 원리금 상환을 요구할 수 있는 상환청구권과 최대주주인 지주사 일동홀딩스를 상대로 행사할 수 있는 주식매수청구권이 붙어 있었다. 지난해 말 자본총계가 마이너스 555억원인 완전자본잠식 상태의 아이디언스나 지주사 일동홀딩스 대신, 현금 창출력이 있는 일동제약이 외부 FI의 엑시트 물량과 풋옵션 계약을 그대로 떠안아 그룹 차원의 재무 리스크를 방어한 셈이다.

일동제약은 올해 3분기 별도 기준 매출 1505억원, 영업이익 77억원, 당기순이익 40억원을 기록했으나, 자회사 손익 등이 반영된 연결 기준으로는 매출 1510억원, 영업이익 71억 원에 44억원의 당기순손실을 내며 적자 전환했다. 상반기 말 연결 기준 현금및현금성자산은 534억원(별도 기준 517억원)인 데 반해 단기성 금융부채는 1162억원에 달한다. 지난달 집행한 아이디언스 구주 인수 대금(368억원)만으로도 상반기 말 보유 현금의 약 69%(별도 기준 71%)가 빠져나간 상태다.

유노비아 합병으로 본사가 직접 챙기게 된 경구용 비만·당뇨 신약 후보물질 'ID110521156(저분자 GLP-1 수용체 작용제)' 역시 후기 임상 자금 조달이 핵심 과제로 남아 있다. 국내 임상 1상(4주 투여)에서 최대 13.8%, 최고 용량군(200mg) 평균 9.88%의 체중 감량 효과를 확인했으나, 정상인 중심의 소규모(코호트당 투약군 10명) 초기 임상인 만큼 대규모 글로벌 임상 2상에서 경쟁력을 입증해야 한다.

회사는 최근 열린 '2026 바이오 유럽(BIO-Europe)'에서 대원제약과 공동개발해 임상 3상 톱라인을 확보한 위식도역류질환 신약 '파도프라잔'의 해외 판권 계약과 함께 ID110521156의 기술이전·공동개발 파트너 물색에 나선 바 있다.

일동제약 관계자는 "이번 행사에서 회사는 글로벌 파트너사와 접촉해 '파도프라잔'과 비만치료제 'ID110521156' 등 회사가 보유한 유망 신약 파이프라인과 관련한 사업화 논의를 진행했다"면서 "사전에 약속된 미팅뿐 아니라 현장에서도 여러 차례의 문의와 접촉이 있었고, GLP-1과 관련한 협업 논의 외에 P-CAB 제제인 파도프라잔에 대한 권역별 라이선스 아웃 등 사업 제휴 측면에서 진전된 이야기가 오갔다"고 말했다.

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